Scrapie Bewaking is gebaseerd op een reglement van GD. Eén procent van de dieren (minimaal één dier) moet jaarlijks worden onderzocht. De voor onderzoek aangewezen dieren moeten minimaal twee jaar oud zijn en op het bedrijf zijn geboren of daar minimaal twee jaar hebben verbleven. Voor bedrijven met twintig dieren of minder is er een regeling om in plaats van onderzoek van één kop per jaar de koppen van alle dieren afgevoerd voor de dood of destructie voor onderzoek aan te bieden, met een minimum van één kop per twee jaar.